Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Misiune:
Laboratorul de Genetică, Genomică și Patologie Experimentală (LGGPE) este parte a infrastructurii de cercetare a Institutului Oncologic „Prof. Dr. Ion Chiricuță” Cluj-Napoca, centru comprehensiv de cancer specializat în furnizarea de servicii medicale de prevenție, curative și paliative în domeniul oncologic și activitate de cercetare.
LGGPE, în colaborare cu departamentele clinice, este activ implicat în evaluarea caracteristicilor moleculare și celulare ale tumorilor maligne. LGGPE deține o platformă completă de genomică, microfluidică și facilități multiple de biologie moleculară, inclusiv facilități pentru studii in vitro și in vivo. Colaborările LGGPE sunt în domeniul cercetării fundamnatale și translaționale, având în prin plan abordări de genomică și microfluidică.
Strategia Departamentului
Strategia LGGPE se bazează în principal pe combinarea de cercetari fundamentale cu cele translaționale, cu scopul imbunătățirii diagnosticului precoce și al prognosticului pacientilor cu cancer. Studiile de cercetare fundamentala implica identificarea alterărilor moleculare transcriptomice implicate în dezvoltarea și evoluția tumorilor maligne, respectiv a răspunsului tumoral la variate tratamente cu compuși chimici și biochimici. Abordările translaționale implică integrarea datelor moleculare cu caracteristicile clinice ale pacienților pentru a identifica posibili biomarkeri care pot ajuta in predictionarea răspunsului la terapie în cancer. Strategii microfluidice de tip organ-on-a-chip sunt folosite pentru a explora interacțiunile celulare și moleculare complexe din micromediul tumoral care guvernează mișcarea celulelor tumorale și stromale în spații restrictionate mecanic 3D, tranziția epitelială la mezenchimală (EMT), potențialul stem-like tumorale și formarea sferoizilor. Domeniile noastre de interes includ cancerul de sân, de colon, ovarian, de col uterin, de prostată
Structura laborator
Tehnologiile state-of-the-art ale LGGP includ facilităţi de analiză la nivel genomic și genetic, analize de biologie moleculară, microfluidică respectiv facilități pentru studii in vitro și in vivo.
Activități de cercetare fundamentală și translațională:
1.Procesarea probelor biologice tumorale și normale (țesut, sânge, urina) în vederea izolarii de ADN, ARN, miARN, ser, plasmă, proteine;
2.Studii de evaluare a calității și cantității acizilor nucleici (ARN, miARN, ADN) prin analiza Lab-on-a chip (Bioanalyzor 2100), spectromtrie, (Nanodrop ND-1000) și fluorimetrie (Qubit 3.0).
3.Menținerea și întreținera liniilor celulare tumorale imortalizate.
4.Studii pe culturi celulare pentru evaluarea efectelor citotoxice și a mecanismelor moleculare modulate de diferiți compuși convenționali (medicamente citostatice și imunoterapice) și neconvenționali (compuși bioactivi).
5.Studii de apoptoza celulara prin citometrie in flux.
6.Design și fabricare de dispozitive de microfluidică specifice pentru caracterizarea fenotipului malign.
7.Studii de evaluare a capacității de migrare si invazie a liniilor celulare și a subpopulațiilor celulare izolate din probe biologice tumorale în dispozitive microfluidice
8.Identificarea alterarilor moleculare asociate fenotipului malign; studii de transcriptomică (tesut, sange integral) prin microarray (WHG) asupra speciilor de mARN, miARN, lncARN, circARN și analiza bioinformatică și biostatistică; validarea datelor obținute prin tehnologii complementare (PCR, qRT-PCR, IHC, Western Blot, ELISA) la nivel transcipțional și de traducere a informației genetice;
9.Teste de funcționalitate moleculară a datelor de microarray pe studii in vitro pe culturi celulare și model animal; Studii in silico (Ingenuity, Gene Spring, Cytoscope, KEGG, etc)
10.Utilizarea tehnologiilor de ARN interferență în vederea realizării controlului posttranscripțional al expresiei genelor;
11.Utilizarea de vectori plasmidici pentru supraexpimarea unor gene de interes în vederea identificării și validării rolului acestora în cancer precum și a mecanismelor de semnalizare implicate;
12.Evaluarea farmacogenomică a acţiunii medicamentelor citostatice (studii in vitro si in vivo); identificarea mecanismelor moleculare implicate in inducerea apoptozei si a rezistentei la terapie (culturi celulare, xenogrefe, tumori).
13.Studii de bioinformtică și biostatistică pentru analiza datelor de genomică din bazele de date de specialitate (TCGA, CCLE, etc);
14.Studii in silico pentru determinarea amorselor (primerilor) și a sondelor fluorescente (UPL) utilizate în analizele de expresie genică prin qRT-PCR;
Activități pentru suport clinic
Evaluarea infecțiilor nozocomiale. LGGPE are capacitate de testare rapida pe sistem performant de analiză IVD (Cepheid GeneXpert), prin PCR, pe probe biologice (spută, sânge), pentru:
•detecția C. difficile tcdB (gena toxinei B), cdt (gena toxinei binare) și deleția unei nucleotide la poziția 117 în gena tcdC (ribotipul tulpinii 027) a pacienților suspecți de infecția cu Clostridium difficile.
•detecția secvențelor genelor blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaOXA-48 și blaIMP-1 asociate cu Enterobacteriaceae, Pseudomonas aeruginosa și specii de Acinetobacter producătoare de carbapenemaze.
•detecția infecției cu Staphylococcus aureus (SA) și a genei mecA din stafilococii rezistenți la meticilină (MRSA).
•detecția genelor vanA/vanB din enterococii rezistenți la vancomicină (VRE).
•detecția diferitelor tipuri de bacterii rezistente precum: C difficile, metallo-β-lactamase (MBL)-cu patogeni gram-negativ” IMP, NDM și VIM, etc.
Detecția infecției cu SARS-Cov2 prin metoda RT-qPCR pe sistem PCR deschis și pe sistem PCR inchis (cartus-Xpert SARS-CoV-2)
1. Facilități complete pentru procesarea probelor biologice (țesut, sînge, urina): hote în flux laminar, set de centrifugi cu ăi fără răcire; politron pentru mărunțirea probelor tisulare; termoblocuri, băi de apa cu agitare termo-reglabile, vortexuri, centrifugi minispin, concentrator de acizi nucleici, frigidere, minicongelatoare, pipete; (achiziție aparatură 2007-2012)
2. Tancuri (stocatoare) de azot lichid (-1960C), ultracongelatoare (-800C), si congelatoare (-200C); (achiziție aparatura 2007-2010)
3. Platforma genetica si genomica Illumina: NGS NextSeq 550Dx si scanner iScan; (achizitie 2022).
4. Platforma microarray Agilent pentru: analize genomice transcripționale (mRNA, miRNA, lncRNA), hibridare genomică comparativă (CGH), analiza a cromatinei (ChIP-on chip) si metilare. (achiziție 2007)
5. Facilități bioinformatice pentru analize de genomică și funcționalitate moleculară: Bioconductor R, Feature Extraction, Gene Spring și Ingenuity; (licențe 2009 -prezent)
6. Aparat PCR (MiniAmp Thermal Cycler, Thermo) pentru amplificarea materialului genetic (ADN); (achiziție 2019)
7. Aparate de qRT-PCR (Light Cycler 480, si Cobas Z480, Roche Tehchnologies) utilizate pentru analiza de expresie genica si genotipare; (achiziție 2007 și 2020)
8. Tehnologii Lab-on-a-chip (Bioanalyzer 2100) și Spectrofotometru NanoDrop ND-1000 si Qubit 3.0 utilizate în QC pentru acizi nucleici și proteine; (achiziție 2002 UMF, parte din platforma de genomica comuna IOCN-UMF).
9. Facilități pentru evaluare de proteine: Mini-PROTEAN 3 unități pentru electroforeza și Western blot, cititor de placi pentru ELISA – UV-VIS, fluorescenta; (achizitie 2010-2017)
10. Facilități complete pentru culturi celulare: hota in flux laminar complet utilata, incubatoare cu CO2 termoreglabil (posibilitate de inducere hipoxie), microscop optic si in fluorescenta, Agitator de placi cu controlul temperaturii, Numarator automat de celule Sistem de evaluare a celulelor in timp real prin Time-Lapse imaging (Mini-incubator cu microscop: Biostation IMq) (achizitie 2009-2017).
11. Sisteme pentru izolarea și caracterizarea nanoparticulelor și a veziculelor extracelulare (exosomi): IZON Automatic Fraction Collector; IZON Exoid (Achizitie 2023)
12. Platforma pentru microfabricatie dispozitive microfluidice: Aparat oxigen plasma, Cuptor, centrifuga (Laurell), Aparat de litografiat (UV-KUB3) (achizitie 2017),
13. Sistem de evaluare si sortare a celulelor (S3 sorter Bio-Rad) (achizitie 2017)
14. Sistem IVC pentru cresterea in conditii SPF a animalelor de laborator mici (achizitie 2017)
Infrastructura programata a fi achizitionata in 2025: (Finantare prin proiect ROGEN- Dezvoltarea Cercetarii Genomice in Romania)
1. Instrument de partitionare la nivel unicelular a suspensiilor celulare, suport pentru analiza de single-cell sequencing (ADN, ARN si profil imun).
2. Sistem complet de analiza Westen-Blot cu cititor de geluri in fluorescenta si chemo-luminiscenta (iBright FL1500 Imaging System)
3. Statie de pipetare automata pregatire librarii NGS, compatibila cu o gama larga de kituri de analiza NGS, destinate pentru paltformele de secventiere Illumina
4. Dezagregator tisular, cu controlul crio-conservarii probelor, ca suport pentru analizele de secventiere unicelulara (single-cell).
5. Sistem automatizat, de evaluare microscopica motorizata a culturilor celulare 2D-3D cu unitate de injectie reactivi.
Europene, parteneriate:
1. HORIZON 2020 – ERANET-PERMED: Modele epigenomice și de învățare automată pentru predictia cancerului pancreatic: dezvoltarea unui nou algoritm ce integreaza biomarkeri clinici, omici, de metilare a ADN-ului și factori de mediu pentru detectarea precoce a cancerului pancreatic. Acronim: IMAGENE (990.000 Lei) (274/2022) (2022-12024).
2. HORIZON 2020- ERANET-TRANSCAN-3- Predicția răspunsului la imunoterapie bazată de inteligența artificială – TANGERINE – 319 ⁄ 2022- 2024 (990.000 lei) (2022-2024). (2022-2024).
Naționale, coordonare:
1. PED – (PN-IV-P7-7.1-PED-2024-2349) Dezvoltarea unei platforme integrate pentru evaluarea fenotipului migrator al celulelor tumorale bazată pe dispozitivie microfluidice și algoritmi de învățare automată – MCELLML, (723 8680 lei).
2. TE – (PN-III-P1-1.1-TE-2021)- Abordari microfluidice pentru reconstructia nisei metastatice in cancerul de san – MIOCRONICHE – TE52/2022 (450.000 lei)
3. PED – (PN-III-P2-2_1-PED) -Explorarea mecanismelor moleculare mediate de exozomii plasmatici responsabili de fenotipul migrator al celulelor primare de cancer mamar folosind abordări microfluidice și genomice- EXOMICROVEL – PED556/2020 (600.000 lei).
4. PN-III-P1-1.1-PD-2019-0846-Studii in vitro privind proprietățile antitumorale și chemopreventive ale β-criptoxantinei, zeaxantinei și a extractului lipofil de cătină (Hippophae rhamnoides L.) în cancerul de sân. BREASTMICROGENIMICS, 236 150 lei, (2020-2022)
5. PNIII (UEFISCDI) The role of miRNAs in the regulation of FA/BRCA pathway with implications in baseline resistance of cervical cancer – Rez-miR-Cervix – 247PED/2017 (475.000 lei).
6. PNII (UEFISCDI) – Analiza miARN ca posibili biomarkeri cu valoare de predictie pentru tratamentul cancerului de col uterin, în relaţie cu expunerea la factorii de mediu, arsen, ftalaţi şi cotinina. (Cervicall-arsen-array) 3.000.000 RON (96/2012)
7. POC- p37-783- Abordari genomice si microfluidice in blocarea invaziei si a metastazarii cancerului de san BREASTMICROGENOMICS (8.617.500 RON) (2016-2020)
8. TE – (PN-II-RU-TE-2014) – Rolul ARN-urilor non-codante lungi in rezistenta celulelor stem-like tumorale la terapie in cancerul de san – BREAST-STEM-RES – TE76/2015 (550.000 lei)
9. PNII (UEFISCDI) – Analiza miARN ca posibili biomarkeri cu valoare de predictie pentru tratamentul cancerului de col uterin, în relaţie cu expunerea la factorii de mediu, arsen, ftalaţi şi cotinina. (Cervicall-arsen-array) 3.000.000 RON (96/2012).
10. PD (PN-II-RU-PD-2011) – Dubla tintire a VEGFA si PDGFb in cancerul cervical: posibilitate terapeutica antiangiogenica utilizand CPPs receptor specifice – PD102/2012 (300.000 lei)
11. CNMP (PNCDI II) – Identificarea profilelor moleculare transcriptomice in cancerul de col uterin avansat prin studii de genomica functionala. CERVIX-array. 1.200.000 RON (IOCN) (2008-2011). (42-160/2008).
12. CNCSIS- IDEI – Identificarea prin reactia microarray a unor biomarkeri tumorali cu valoare de predictie noninvaziva in cancerul de prostata. 1.000.000 RON (IOCN) (ID_314/2007)
13. CNMP (PNCDI II) Modulation of pro/anticarcinogenic effect of toxic chemical agents in breast cancer multitargeted therapy (CANCERTER-p53) (PN-II-PT-PCCA-2013-4-0030), (196/2014), 690.700 RON (IOCN) (2013-2017).
14. PNII (UEFISCDI) – Evaluarea diversităţii genetice existente la nivelul cultivarelor românesti, în vederea obţinerii de hibrizi noi, cu trăsături superioare şi productivitate (ZEAHYBR/2012) (UEFISCDI, PN-II-PT-PCCA) 500.000 RON (2012-2015)
15. CNMP (PNCDI II) – Definirea profilului molecular transcriptomic in predictia statusului clinic in cancerele mamare rezistente la antracicline. Definirea bolii metastatice in raport cu tumora primara. BREAST-OMICS. 800.000 RON partener IOCN (41-029/2007)
16. POSDRU-TDM – Sistem de formare profesională a personalului medical în domeniul noilor tehnologii din sistemul de sănătate (diagnostic molecular) POSDRU/81/3.2/S/58819
Naționale, colaborare:
1. PS/272/PS_P5/OP1/ROS1.1/PS_P5_RSO1.1_A9/- Dezvoltarea Retelei de Genomica in Romania (ROGEN) 2025-2030 (1.899.555 Euro, IOCN).
2. PD – (PN-III-P1-1.1-PD) – Investigarea rolului factorului de transcriere ELK3 în migrarea celulelor de cancer de sân triplu negativ, într-o abordare genomică și microfluidică – MICROGENOELK – PD0525/2021 (250.000 lei). Colaborare cu Universitatea „Babeș-Bolyai”
3. PD – (PN-III-P1-1.1-PD) – Investigarea rolului factorului de transcriere ELK3 în migrarea celulelor de cancer de sân triplu negativ, într-o abordare genomică și microfluidică – MICROGENOELK – PD0525/2021 (250.000 lei). Colaborare cu Universitatea „Babeș-Bolyai”.
4. PN-III-P1-1.1-TE-2021-1512 – „Functional immune profiling in peripheral mononuclear cells to inform personalized approaches in patients with systemic lupus erythematosus” – FiLup (450.000,00 lei) (2022-2024)
5. PD – (PN-III-P1-1.1-PD) – Explorarea potențialului terapeutic al curcuminei pe linii celulare de cancer colorectal rezistente la irinotecan PD0469/2019 (250.000 lei). Colaborare cu Universitatea de Medicină și Farmacie „Iuliu Hațieganu”
6. PN-III-P1-1.1-TE-2019 -1603- “Next generation sequencing – a valuable tool for assessing the impact of additional somatic mutations in young patients with non-BCR-ABL myeloproliferative neoplasms” (2020-2022).
7. CDI, ID P_40_318, Cercetare, dezvoltare tehnologică și inovare (CDI) în sprijinul competitivității economice și dezvoltării afacerilor” Transfer de cunoștințe în aplicații clinice ale biogenomicii în oncologie și domenii conexe- BIOGENONCO, Colaborare cu Universitatea de Medicină și Farmacie „Iuliu Hațieganu” (2018-2022).
8. CDI, ID P_37_762 Cod MySMIS: 103587- HINT „Hiperuricemia induce INflamaţie: Ţintirea rolului central al acidului uric în bolile reumatologice şi cardiovasculare”, Acțiunea 1.1.4 Atragerea de personal cu competențe avansate din străinătate pentru consolidarea capacității de CD. (9.352.330 lei din care asistenţa financiară nerambursabilă 8.617.499,04 lei) (2016-2020).
Competențe: Tehnici și metode de biologie celulară: culturi celulare de linii tumorale standardizate și culturi celulare primare in vitro; experimente de migrare celulară în dispozitive microfluidice; microscopie optică; spectrofotometrie; Imunocitochimie (ICC); Tehnici și metode de biologie moleculară: Extracția ADN, ARN, miRNA și proteine din probe biologice (țesut, țesut inclus în parafină, sânge, culturi celulare, mamosfere) prin metoda clasică (fenol-cloroform) și cu ajutorul kiturilor speciale cu coloane de gel silicat; cuantificarea acizilor nucleici (Nanodrop ND-1000, Bioanalizor Agilent, Qubit 3.0); sinteză de ADNc; tehologia PCR: PCR calitativ (electroforeză), qRT-PCR, PCR array; Sinteza sondelor Cy3-ARNc pentru analiza de tip microarray; Tehnici de anatomie patologică: imunohistochimie (IHC) și imunofluorescență (IF); Instrumente bioinformatice: Ingenuity Pathways Analysis (IPA), GraphPad Prism, TCGA (cBioPortal), UCSC Genome Browser; Tehnici și metode complementare domeniului: Procesarea probelor biologice (sânge, ser, plasmă, țesut, lavaj citologic) folosite în analizele de biologie moleculară și studiile de genomică funcțională; evaluarea capacității antioxidante intracelulare (metoda ROS), respectiv extracelulare (DPPH, TEAC, ORAC, FRAP) ale extractelor de origine vegetală și a unor compuși bioactivi standardizați; Izolarea celulelor nucleate din sânge utilizând ficol; Genotiparea unor polimorfisme specifice anumitor patologii; Diagnostic molecular: Genotiparea HPV, Identificarea mutațiilor BRAF, Detecția în sistem Cepheid GeneXpert a Enterobacteriaceaelor, Pseudomonas aeruginosa și a speciilor de Acinetobacter producătoare de carbapenemaze; a Staphylococcus aureus și a stafilococilor rezistenți la meticilină; a enterococilor rezistenți la vancomicină; a infecției cu Clostridium difficile, Diagnostic molecular al infecției cu virusul SARS-CoV-2;
Domenii de activitate și interes: Studii de oncologie comparativă (analize de genomică funcțională și tehnici de anatomie patologică: IHC și IF) pe modelul uman-canin cu scopul de a identifica noi biomarkeri (din țesut sau sânge) de diagnostic și prognostic în patologia mamară umană și canină; Studii de genomică funcțională cu scopul de a identifica mecanismele moleculare activate de tratamentele cu compuși naturali bioactivi în patologia mamară umană și canină; Identificarea unor terapii adjuvante sau alternative eficiente bazate pe compuși naturali bioactivi (extracte vegetale sau compuși standardizați) utilizate în cancerul mamar canin și uman
E-mail: simona.visan19@gmail.com
Specializare: Biologie moleculară și celulară, Biotehnologii moleculare
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Competențe: Tehnici și metode de biologie moleculară: izolare acizi nucleici din sânge/ țesut/ culturi celulare; cuantificare acizi nucleici (nanodrop, bioanalizor, qubit); sinteză cDNA; PCR, RT-PCR, RT-qPCR. Procesarea probelor biologice (sânge/ plasmă/ ser/ biopsie) folosite în analizele de biologie moleculară și studiile de genomică funcțională; diagnostic molecular al infecției cu virusul SARS-CoV-2 (izolarea ARN-ului viral cu ajutorul kiturilor cu coloane de gel silicat sau cu ajutorul extractorului automat GeneRotex96, analiza moleculară prin RT-PCR cu ajutorul aparatelor Light Cycler480 și CobasZ480, evaluarea pe cartuș în sistem Cepheid Gene Expert); Izolarea celulelor nucleate din sânge utilizând ficol.Tehnici și metode pentru studiile in vivo: injectarea subcutan de celule în matrigel în vederea dezvoltării de xenogrefe; inducere de xenogrefe subcutan şi intraperitoneal; pasajul xenogreflor obţinute
Domenii de activitate și interes: Studii in vivo în vederea identificării unor terapii țintite și a unor biomakeri de diagnostic în diverse neoplazii ginecologice (sân, ovar) utilizate ca și suport în medicina personalizată; Identificarea unor terapii eficiente, bazate pe compuși naturali bioactivi utilizați ca și tratament alternativ sau adjuvant în diverse neoplazii.
E-mail: ghermanclau@yahoo.com
Specializare: Biologie moleculară, Biotehnologii moleculare
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 148
Titluri ştiinţifice: Biolog specialist în genetică și biologie moleculară
Doctor în farmacie
Competențe: Design experimental pentru studii de cercetare fundamentala si cu aplicabilitate clinica; Menținerea și propagarea celulelor primare obținute din probe tisulare tumorale și a celulelor din linii tumorale stabilizate, in vitro; Îmbogătirea subpopulațiilor celulare cu caracteristici stem prin utilizarea condițiilor de cultură specifice și a mediilor selective; Caracterizarea imunofenotipică prin citometrie în flux și imunocitochimie a celulelor tumorale stabilizate și a celulelor primare, precum și sortarea subpopulțiilor de interes pentru subcultivare; Analize de funcționalitate celulară pentru identificarea mecanismelor implicate în malignitate; Analize de biologie moleculară implicând procesarea diferitelor probe biologice (celule, țesut, sânge) și izolarea ARN/ADN, pentru identificarea nivelurilor de expresie genică prin qRT-PCR; Izolarea si evaluarea veziculelor extracelulare din plasmă/ mediu de cultură în vederea izolării miARN-urilor cu potențial de biomarkeri minim invazivi sau ținte terapeutice; Integrarea datelor de genomică și a datelor clinice prin utilizarea platformelor de analiză funcțională (IPA, TGCA) și a programelor de analiză bioinformatică (R)
Domenii de activitate și interes: Identificarea mecanismelor asociate cu prezența celulelor stem-like tumorale în tumorile mamare și prognosticul acestor paciente; Identificarea de noi molecule capabile să îmbunătățească prognosticul pacientelor cu cancer mamar prin țintirea mecanismelor implicate în menținerea celulelor stem-like în tumori; Identificarea unor particularități moleculare asociate migrării și invaziei celulelor tumorale, utilizând dispozitive microfluidice și analize de genomică; Identificarea de noi markeri minim invazivi (miARN exozomali) asociați prognosticului și răspunsului la terapie în patologia tumorală (sân, col uterin, pancreas).
E-mail: oana.baldasici@iocn.ro
Specializare: Biologie moleculară, Genetică
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 348
Titluri ştiinţifice: Biolog specialist în genetică și biologie moleculară
Doctor în biologie
Competențe: Tehnici și metode de biologie celulară: cultură celulară in vitro; citotoxicitate și viabilitate celulară; transfecție celulară cu miRNA și siRNA; transductie celulară mediată lentiviral; experimente de migrare celulară în dispozitive microfluidice; citometrie în flux continuu; microscopie optică; spectrofotometrie; Tehnici și metode de biologie moleculară: izolare acizi nucleici din sânge/ țesut/ culturi celulare; cuantificare acizi nucleici (nanodrop, bioanalizor, qubit); sinteză cDNA; PCR, Nested PCR, RACE-PCR, RT-PCR, RT-qPCR; electroforeză; WesternBlot; Instrumente bioinformatice: Ingenuity Pathways Analysis (IPA), GraphPad Prism; elemente de bază în Integrative Genome Viewer (IGV), TCGA (cBioPortal), UCSC Genome Browser, GTEx Portal; Tehnici și metode complementare domeniului: Prelucrare probe biologice (sânge/ plasmă/ ser/ biopsie); diagnostic molecular al infecției cu virusul SARS-CoV-2; producere extracte vegetale farmaceutice; evaluare a conținutului de metaboliți secundari (spctrofotometrie; HPLC; GS-MS); cultură bacteriană in vitro.
Domenii de activitate și interes: Identificarea unor ținte terapeutice moleculare din rândul oncoproteinelor implicate în metastazare în cancerul mamar, în vederea dezvoltării abordărilor medicinei personalizate; Identificarea unor molecule cu valoare de diagnostic și prognostic din rândul microARN-urilor în sângele paciențelor cu cancer de sân și de col uterin, în vederea dezvoltării metodelor minim-invazive de diagnostic și prognostic în aceste patologii; Identificarea unor terapii eficiente, complementare chimioterapiei convenționale, bazate pe compuși naturali de origine vegetală în cancerul de sân și cancerul colo-rectal.
E-mail: dani.cruceriu@gmail.com
Specializare: Biologie moleculară, Epigenetică
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 348
Competențe: Tehnici și metode de biologie celulară: Culturi celulare de linii tumorale standardizate (menținerea în cultură a liniilor celulare imortalizate, pasaje, înghețare, dezghețare, teste de citotoxicitate și viabilitate); Culturi celulare primare (procesarea mecanică și enzimatică a biopsiilor mamare, creșterea în medii de cultură selective în vederea izolarii celulelor tumorale diferențiate, pasaje, înghețare, dezghețare); Construcţie şi funcţionalizare dispozitive microfluidice; experimente de migrare celulară în dispozitive microfluidice; evaluara capacităţii vitezei de migrare a celulelor izolate din biopsii. Tehnici și metode pentru studiile in vivo: Inducere de xenogrefe subcutan şi intraperitoneal. Pasajul xenogreflor obţinute; Tehnici de anatomie patologică: IHC, IF; Tehnici și metode complementare domeniului: Procesarea probelor biologice (sânge, ser, plasmă, țesut, lavaj citologic) folosite în analizele de biologie moleculară și studiile de genomică funcțională; diagnostic molecular al infecției cu virusul SARS-CoV-2 (izolarea ARN-ului viral cu ajutorul kiturilor cu coloane de gel silicat sau cu ajutorul extractorului automat GeneRotex96, analiza moleculară prin RT-PCR cu ajutorul aparatelor Light Cycler480 și CobasZ480, evaluarea pe cartuș în sistem Cepheid Gene Expert; Izolarea celulelor nucleate din sânge utilizând ficol;
Domenii de activitate și interes: Realizarea de dispozitive de microfluidică funcționalizate ca suport al cercetării fundamentale și translaționale; Studii in vivo în vederea identificării unor terapii țintite și a unor biomakeri de diagnostic în diverse neoplazii ginecologice (sân, ovar) utilizate ca și suport în medicina personalizată; Identificarea unor terapii eficiente, bazate pe compuși naturali bioactivi utilizați ca și tratament alternativ sau adjuvant în diverse neoplazii
E-mail: flaviudrigla@gmail.com
Specializare: Biologie moleculară și celulară, Biotehnologii moleculare
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 148
Titluri ştiinţifice: Cercetător științific gradul II, specialitatea genomică funcțională
Doctor în inginerie biochimică
Competențe: Biologie moleculara: Izolare si cuantificare cantitativa si calitativa ADN, ARN, miRNA și proteine din probe biologice (țesut, sânge, celule, exozomi); culturi celulare primare si sferoizi; transfectii cu siRNA/ plasmide/ miRNA; analiza fluorescenta prin RNA scope; analiza viabilitate/ invazie/ migrare; microscopie de tip time-lapse; sortare celulara prin citometrie de flux; Western-Blot/ELISA; analize de expresie genica de tip PCR/ qRT-PCR/ PCRarray si whole human genome prin microarray, preparare de librarii NGS, studii de dinamica tumorala in vivo. Microfluidica: design de masti in AutoCad; fabricare matrite prin litografiere; turnare PDMS, asamblare si testare dispositive. Bioinformatica: utilizare softuri si baze de date precum IGV, UCSC Genome Brower, GSEA, IPA, GEPIA, XCELL, TCGA, etc pentru analiza functionala a datelor de genomică si integrarea acestora cu cu cele clinice. Management: Identificare oportunități de finanțare, planificarea și redactarea cererilor de finanțare, implementare programe de granturi nationale si europene
Domenii de activitate și interes: Studii de genomică și analize funcționale pentru identificarea alterărilor moleculare asociate fenotipului malign; (sân, ovar, col uterin, colon); Identificarea mecanismelor moleculare (genetice/epigenetice) asociate rezistenței la terapie (radio-chimioterapie) în diferite tipuri de cancere (sân, col uterin, colon); Identificarea unor particularități moleculare asociate migrării și invaziei celulelor tumorale mamare, utilizând dispozitive de microfluidică și analize de genomică; Decodificarea rolului micromediului tumoral in determinarea fenotipului stem-like si invaziv al celulelor tumorale mamare; Design, fabricare și testare de dispozitive de microfluidica funcționalizate, ca suport al cercetării fundamentale și translaționale.
E-mail: oana.tudoran@iocn.ro
Specializare: Biologie tumorală, Genomică funcțională, Microfluidică
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 348
Titluri ştiinţifice: Cercetător științific gradul I, specialitatea genomică funcțională
Doctor în biologie
Competențe: Design studii microarray, dezvoltare și optimizare rutine de analiză în R/Bioconductor pentru controlul de calitate, vizualizarea, procesarea și analiza diferențială a datelor NGS (RNA-seq) și microarray (mRNA, miRNA, lncRNA), adnotare secvențe, analiză funcțională (R/Bioconductor, IPA, GSEA, Reactome), predicția țintelor microARN, analiza datelor genomice din baze de date publice (TCGA, CCLE, GEO) și corelarea cu datele clinice, analize statistice, management și implementare proiecte naționale și europene.
Domenii de activitate și interes: Design și analiză bioinformatică pentru generarea de ipoteze stiintifice și identificarea alterărilor moleculare asociate fenotipului malign (col uterin, sân, colon, ovar, prostată); analiza integrativă a datelor (genomice, clinice) pentru studiul markerilor asociați prognosticului și răspunsului la terapie în diverse patologii tumorale (sân, col uterin, colon).
E-mail: loredanabalacescu@iocn.ro, loredana_balacescu@yahoo.com
Specializare: Bioinformatică, Genomică funcțională, Statistică
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 348
Titluri ştiinţifice: Cercetător științific gradul I, specialitatea genomică funcțională
Doctor în farmacie
Sef Laborator Genetică, Genomică și Patologie Experimentală
Competențe: Evaluare ADN, ARN, miRNA și proteine din probe biologice (țesut, sânge, celule, exozomi); control de calitate acizi nucleici prin tehnolgia Lab-on-a-chip (Agilent); analize PCR, qRT-PCR, PCRarray, microarray (mARN, miARN, lncARN), studii de hemogenomică, CGH, pyrosecvențiere, IHC, Western-Blot, analiza funcțională (IPA, DAVID, KEGG, GO, GSEA); analiza baze de date publice (TCGA, CCLE, GEO, Genome Browser), predicția țintelor microARN, lncARN, circARN; analiza integrativă folosind date de genomică și date clinice; studii de farmacogenomică pe modele in vitro și in vivo. Management: design, redactare, implementare și coordonare proiecte de cercetare naționale și europene; implementare și coordonare diagnostic molecular al infecției cu virusul SARS-CoV-2 în cadrul programului național de supraveghere și control al bolilor transmisibile prioritare.
Domenii de activitate și interes: Studii de genomică și analize funcționale pentru identificarea alterărilor moleculare asociate fenotipului malign (sân, ovar, col uterin, colon, prostată); Identificarea mecanismelor moleculare (genetice/epigenetice) asociate rezistenței la terapie (radio-chimioterapie) în diferite tipuri de cancere (sân, col uterin, ovar, colon); Identificarea în biopsia lichidă de noi biomarkeri (miARN exozomali) asociați prognosticului și răspunsului la terapie în patologia tumorală (sân, colon); Identificarea unor particularități moleculare asociate migrării și invaziei celulelor tumorale, utilizând dispozitive de microfluidica și analize de genomică.
E-mail: ovidiubalacescu@iocn.ro; obalacescu@yahoo.com
Specializare: Biochimie, Biologie moleculară, Farmacogenomică, Genomică funcțională
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Competențe: Izolare celule periferice mononucleate din sange periferic. Extracții de ADN din sânge, măduvă și tumori parafinate, extracții de ARN din măduvă, sange și țesut, cuantificarea acizilor nucleici extrași folosind nanotehnologii (Bioanalizor 2100 și Nanorop ND-1000), analiza de expresie genică prin tehnica qRT-PCR, tehnologia Roche, evaluare BCR-ABL la pacienții cu leucemie mieloidă cronică și leucemie acută limfoblastică, electroforeză pentru mutația V617F pe gena JAK2 întalnită în neoplasme mieloproliferative, respectiv variații pe genele FLT3 și NPM în leucemii acute. Testare genetică pentru mutații implicate în cancerele solide, ca markeri diagnostici și prognostici, de exemplu mutațiile BRAF în melanom, mutațiile KRAS și NRAS în cancerul colo-rectal, mutațiile EGFR în cancerul pulmonar. Analiză integrativă folosind date de genomică și date clinice.
Domenii de activitate și interes: Mecanismele imunologice în bolile autoinflamatorii şi autoimune precum şi interrelaţia acestora cu factorii individuali de susceptibilitate genetică; Variante genetice ale sistemului imun și susceptibilitate pentru boli metabolice; Factori genetici implicați în apariția hemopatiilor maligne și a cancerelor solide
E-mail: orsigaal92@gmail.com
Specializare: Biologie moleculară și celulară, Biotehnologii moleculare, Genetică
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 148
Competențe: Extracții de ADN din sânge, măduvă și tumori parafinate, extracții de ARN din măduvă, sange și țesut, cuantificarea acizilor nucleici extrași folosind nanotehnologii (Bioanalizor 2100 și Nanorop ND-1000).
E-mail: bobgabriela85@yahoo.com
Specializare: Biochimie
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Interior cabinet: 148
Competențe: Managementul stocurilor de reactivi și consumabile, fluxul reactivilor și consumabilelor specifice fiecărui tip de activitate, evidența facturilor și evidența mijloacelor fixe, controlul de calitate al funcționării frigiderelor; Colectarea și stocarea probelor, procesarea probelor biologice din sânge: ser, plasmă, sânge trireagent în vederea extracției de ARN;Activități specifice fluxului de analize SARS-CoV-2
E-mail: sorina.florea67@gmail.com
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Competențe: Procesarea probelor biologice din sânge: ser, plasmă, sânge trireagent în vederea extracției de ARN; Extracții de ADN din sânge, măduvă și tumori parafinate, extracții de ARN din măduvă, sange și țesut, Cuantificarea acizilor nucleici extrași folosind nanotehnologii (Bioanalizor 2100 și Nanodrop ND-1000), analiza de expresie genică prin tehnica qRT-PCR, tehnologia Roche; Ealuare BCR-ABL la pacienții cu leucemie mieloidă cronică și leucemie acută limfoblastică, electroforeză pentru mutația V617F pe gena KAK2 întalnită în neoplasme mieloproliferative, respectiv variații pe genele FLT3 și NPM în leucemii acute; Realizarea de dispozitive de microfluidică funcționalizate ca suport al cercetării fundamentale și translaționale.
E-mail: claudia_lobont@yahoo.com
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Specializare: Medicină de laborator
Interior cabinet: 148
Departamente cercetare: Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
1. Achimas-Cadariu P, Kubelac PM, Pasca A, Gata VA, Fetica B, Balacescu O, Fischer-Fodor E, Focsan M, Astilean S, Vlad CI. Intraoperative imaging of residual ovarian cancer after neoadjuvant chemotherapy using indocyanine green. Int J Gynecol Cancer. 2024 Nov 4:ijgc-2024-005568. doi:10.1136/ijgc-2024-005568. Epub ahead of print. PMID: 39496391.
2. Major TJ, Takei R, Matsuo H, Leask MP, Sumpter NA, Topless RK, Shirai Y, Wang W, Cadzow MJ, Phipps-Green AJ, Li Z, Ji A, Merriman ME, Morice E, Kelley EE, Wei WH, McCormick SPA, Bixley MJ, Reynolds RJ, Saag KG, Fadason T, Golovina E, O’Sullivan JM, Stamp LK, Dalbeth N, Abhishek A, Doherty M, Roddy E, Jacobsson LTH, Kapetanovic MC, Melander O, Andrés M, Pérez-Ruiz F, Torres RJ, Radstake T, Jansen TL, Janssen M, Joosten LAB, Liu R, Gaal OI, Crişan TO, Rednic S, Kurreeman F, Huizinga TWJ, Toes R, Lioté F, Richette P, Bardin T, Ea HK, Pascart T, McCarthy GM, Helbert L, Stibůrková B, Tausche AK, Uhlig T, Vitart V, Boutin TS, Hayward C, Riches PL, Ralston SH, Campbell A, MacDonald TM; FAST Study Group; Nakayama A, Takada T, Nakatochi M, Shimizu S, Kawamura Y, Toyoda Y, Nakaoka H, Yamamoto K, Matsuo K, Shinomiya N, Ichida K; Japan Gout Genomics Consortium; Lee C; Asia Pacific Gout Consortium; Bradbury LA, Brown MA, Robinson PC, Buchanan RRC, Hill CL, Lester S, Smith MD, Rischmueller M, Choi HK, Stahl EA, Miner JN, Solomon DH, Cui J, Giacomini KM, Brackman DJ, Jorgenson EM; GlobalGout Genetics Consortium; Liu H, Susztak K; 23andMe Research Team; Shringarpure S, So A, Okada Y, Li C, Shi Y, Merriman TR. A genome-wide association analysis reveals new pathogenic pathways in gout. Nat Genet. 2024 Nov;56(11):2392-2406. doi: 10.1038/s41588-024-01921-5. Epub 2024 Oct 15. Erratum in: Nat Genet. 2024 Nov;56(11):2577. doi: 10.1038/s41588-024-02017-w. PMID: 39406924.
3. Cruceriu D, Balacescu L, Baldasici O, Gaal OI, Balacescu O, Russom A, Irimia D, Tudoran O. Gene expression-phenotype association study reveals the dual role of TNF-α/TNFR1 signaling axis in confined breast cancer cell migration. Life Sci. 2024 Oct 1;354:122982. doi: 10.1016/j.lfs.2024.122982. Epub 2024 Aug 14. PMID: 39151886.
4. Badii M, Nica V, Straton AR, Kischkel B, Gaal O, Cabău G, Klück V, Hotea I; HINT Consortium; Novakovic B, Pamfil C, Rednic S, Netea MG, Popp RA, Joosten LAB, Crișan TO. Downregulation of type I interferon signalling pathway by urate in primary human PBMCs. Immunology. 2024 Oct 1. doi: 10.1111/imm.13858. Epub ahead of print. PMID: 39354748.
5. Baldasici O, Soritau O, Roman A, Lisencu C, Visan S, Maja L, Pop B, Fetica B, Cismaru A, Vlase L, Balacescu L, Balacescu O, Russom A, Tudoran O. The transcriptional landscape of cancer stem-like cell functionality in breast cancer. J Transl Med. 2024 Jun 3;22(1):530. doi: 10.1186/s12967-024-05281-w. PMID: 38831317; PMCID: PMC11149333.
6. Gaal OI, Liu R, Marginean D, Badii M, Cabău G, Hotea I, Nica V, Colcear D; HINT Consortium; Pamfil C, Merriman TR, Rednic S, Popp RA, Crișan TO, Joosten LAB. GWAS-identified hyperuricemia-associated IGF1R variant rs6598541 has a limited role in urate mediated inflammation in human mononuclear cells. Sci Rep. 2024 Feb 12;14(1):3565. doi: 10.1038/s41598-024-53209-7. PMID: 38347000; PMCID: PMC10861580.
7. Lisencu LA, Roman A, Paşca A, Irimie A, Lisencu C, Negrutiu M, Fetica B, Cismaru A, Balacescu O, Tudoran O, Lisencu C. Mammographic assessment of breast density as a tool for predicting the response to neoadjuvant therapy in breast cancer patients. Med Pharm Rep. 2024 Jan;97(1):43-55. doi: 10.15386/mpr-2554. Epub 2024 Jan 29. PMID: 38344331; PMCID: PMC10852117.
8. Abbasi Aval N, Lahchaichi E, Tudoran O, Fayazbakhsh F, Heuchel R, Löhr M, Pettersson T, Russom A. Assessing the Layer-by-Layer Assembly of Cellulose Nanofibrils and Polyelectrolytes in Pancreatic Tumor Spheroid Formation. Biomedicines. 2023 Nov 15;11(11):3061. doi: 10.3390/biomedicines11113061. PMID: 38002061; PMCID: PMC10669291.
9. Cabău G, Gaal O, Badii M, Nica V, Mirea AM, Hotea I; HINT-consortium; Pamfil C, Popp RA, Netea MG, Rednic S, Crișan TO, Joosten LAB. Hyperuricemia remodels the serum proteome toward a higher inflammatory state. iScience. 2023 Sep 14;26(10):107909. doi: 10.1016/j.isci.2023.107909. PMID: 37810213; PMCID: PMC10550725.
10. Visan S, Soritau O, Tatomir C, Baldasici O, Balacescu L, Balacescu O, Muntean P, Gherasim C, Pintea A. The Bioactive Properties of Carotenoids from Lipophilic Sea buckthorn Extract (Hippophae rhamnoides L.) in Breast Cancer Cell Lines. Molecules. 2023 Jun 1;28(11):4486. doi: 10.3390/molecules28114486. PMID: 37298962; PMCID: PMC10254770.
11. Oravetz K, Todea AV, Balacescu O, Cruceriu D, Rakosy-Tican E. Potential antitumor activity of garlic against colorectal cancer: focus on the molecular mechanisms of action. Eur J Nutr. 2023 Sep;62(6):2347-2363. doi: 10.1007/s00394-023-03166-0. Epub 2023 May 4. PMID: 37140645.
12. Baloi A, Costea C, Gutt R, Balacescu O, Turcu F, Belean B. Hexagonal-Grid-Layout Image Segmentation Using Shock Filters: Computational Complexity Case Study for Microarray Image Analysis Related to Machine Learning Approaches. Sensors (Basel). 2023 Feb 26;23(5):2582. doi: 10.3390/s23052582. PMID: 36904788; PMCID: PMC10007319.
13. Ardelean IV, Bălăcescu L, Sicora O, Bălăcescu O, Mladin L, Haș V, Miclăuș M. Maize cytolines as models to study the impact of different cytoplasms on gene expression under heat stress conditions. BMC Plant Biol. 2023 Jan 2;23(1):4. doi: 10.1186/s12870-022-04023-8. PMID: 36588161; PMCID: PMC9806912.
14. Paraschiv M, Csiki M, Diaconeasa Z, Socaci S, Balacescu O, Rakosy-Tican E, Cruceriu D. Phytochemical Profile and Selective Cytotoxic Activity of a Solanum bulbocastanum Dun. Methanolic Extract on Breast Cancer Cells. Plants (Basel). 2022 Nov 27;11(23):3262. doi: 10.3390/plants11233262. PMID: 36501302; PMCID: PMC9740103.
15. Baldasici O, Balacescu L, Cruceriu D, Roman A, Lisencu C, Fetica B, Visan S, Cismaru A, Jurj A, Barbu Tudoran L, Pileczki V, Vlase L, Tudoran O, Balacescu O. Circulating Small EVs miRNAs as Predictors of Pathological Response to Neo-Adjuvant Therapy in Breast Cancer Patients. Int J Mol Sci. 2022 Oct 20;23(20):12625. doi: 10.3390/ijms232012625. PMID: 36293478; PMCID: PMC9604084.
16. Ivan M, Fishel ML, Tudoran OM, Pollok KE, Wu X, Smith PJ. Hypoxia signaling: Challenges and opportunities for cancer therapy. Semin Cancer Biol. 2022 Oct;85:185-195. doi: 10.1016/j.semcancer.2021.10.002. Epub 2021 Oct 7. PMID: 34628029; PMCID: PMC8986888.
17. Lisencu LA, Roman A, Visan S, Bonci EA, Pașca A, Grigorescu E, Mustea E, Cismaru A, Irimie A, Lisencu C, Balacescu L, Balacescu O, Tudoran O. The Role of miR-375-3p, miR-210-3p and Let-7e-5p in the Pathological Response of Breast Cancer Patients to Neoadjuvant Therapy. Medicina (Kaunas). 2022 Oct 20;58(10):1494. doi: 10.3390/medicina58101494. PMID: 36295655; PMCID:PMC9608077.
18. Baldasici O, Pileczki V, Cruceriu D, Gavrilas LI, Tudoran O, Balacescu L, Vlase L, Balacescu O. Breast Cancer-Delivered Exosomal miRNA as Liquid Biopsy Biomarkers for Metastasis Prediction: A Focus on Translational Research with Clinical Applicability. Int J Mol Sci. 2022 Aug 19;23(16):9371. doi: 10.3390/ijms23169371. PMID: 36012638; PMCID: PMC9408950.
19. Gavrilas LI, Cruceriu D, Mocan A, Loghin F, Miere D, Balacescu O. Plant- Derived Bioactive Compounds in Colorectal Cancer: Insights from Combined Regimens with Conventional Chemotherapy to Overcome Drug-Resistance. Biomedicines. 2022 Aug 11;10(8):1948. doi: 10.3390/biomedicines10081948. PMID: 36009495; PMCID: PMC9406120.
20. Gabora K, Bălăcescu O, Trifa A, Morariu AM, Pop B, Vişan S, Fetica B, Piciu A, Piciu D. Thyroid carcinoma associated with other primary neoplasms, a single center study. Med Pharm Rep. 2022 Jul;95(3):275-281. doi: 10.15386/mpr-2346. Epub 2022 Jul 26. PMID: 36060512; PMCID: PMC9387584.
21. Borlan R, Focsan M, Perde-Schrepler M, Soritau O, Campu A, Gaina L, Pall E, Pop B, Baldasici O, Gherman C, Stoia D, Maniu D, Astilean S. Antibody- functionalized theranostic protein nanoparticles for the synergistic deep red fluorescence imaging and multimodal therapy of ovarian cancer. Biomater Sci. 2021 Sep 14;9(18):6183-6202. doi: 10.1039/d1bm01002f. PMID: 34346411.
22. Cruceriu D, Diaconeasa Z, Socaci S, Socaciu C, Balacescu O, Rakosy-Tican E. Extracts of the Wild Potato Species Solanum chacoense on Breast Cancer Cells: Biochemical Characterization, In Vitro Selective Cytotoxicity and Molecular Effects. Nutr Cancer. 2021;73(4):630-641. doi: 10.1080/01635581.2020.1761407. Epub 2020 May 6. PMID: 32372670.
23. Sur D, Balacescu L, Cainap SS, Visan S, Pop L, Burz C, Havasi A, Buiga R, Cainap C, Irimie A, Balacescu O. Predictive Efficacy of MiR-125b-5p, MiR-17-5p, and MiR-185-5p in Liver Metastasis and Chemotherapy Response Among Advanced Stage Colorectal Cancer Patients. Front Oncol. 2021 May 18;11:651380. doi: 10.3389/fonc.2021.651380. PMID: 34084747; PMCID: PMC8167052.
24. Cruceriu D, Baldasici O, Balacescu L, Gligor-Popa S, Flonta M, Man MA, Visan S, Vlad C, Trifa AP, Balacescu O, Achimas-Cadariu P. Critical Aspects Concerning the Development of a Pooling Approach for SARS-CoV-2 Diagnosis Using Large-Scale PCR Testing. Viruses. 2021 May 13;13(5):902. doi: 10.3390/v13050902. PMID: 34067983; PMCID: PMC8152296.
25. Cainap C, Ungur RA, Bochis OV, Achimas P, Vlad C, Havasi A, Vidrean A, Farcas A, Tat T, Gherman A, Piciu A, Bota M, Constantin AM, Pop LA, Maniu D, Crisan O, Cioban CV, Balacescu O, Coza O, Balacescu L, Marta MM, Dronca E, Cainap S. Partnering bevacizumab with irinotecan as first line-therapy of metastatic colorectal cancer improves progression free survival-A retrospective analysis. PLoS One. 2021 Apr 28;16(4):e0248922. doi: 10.1371/journal.pone.0248922. PMID: 33909622; PMCID: PMC8081186.
26. Wu X, Niculite CM, Preda MB, Rossi A, Tebaldi T, Butoi E, White MK, Tudoran OM, Petrusca DN, Jannasch AS, Bone WP, Zong X, Fang F, Burlacu A, Paulsen MT, Hancock BA, Sandusky GE, Mitra S, Fishel ML, Buechlein A, Ivan C, Oikonomopoulos S, Gorospe M, Mosley A, Radovich M, Davé UP, Ragoussis J, Nephew KP, Mari B, McIntyre A, Konig H, Ljungman M, Cousminer DL, Macchi P, Ivan M. Regulation of cellular sterol homeostasis by the oxygen responsive noncoding RNA lincNORS. Nat Commun. 2020 Sep 21;11(1):4755. doi: 10.1038/s41467-020-18411-x. Erratum in: Nat Commun. 2020 Nov 6;11(1):5737. doi: 10.1038/s41467-020-19708-7. PMID: 32958772; PMCID: PMC7505984.
27. Cainap C, Pop LA, Balacescu O, Cainap SS. Early diagnosis and screening in lung cancer. Am J Cancer Res. 2020 Jul 1;10(7):1993-2009. PMID: 32774997; PMCID: PMC7407360.
28. Cismaru AC, Soritau O, Jurj AM, Raduly LZ, Pop B, Bocean C, Miclea D, Baldasici O, Moldovan C, Urian L, Braicu C, Chira S, Cojocneanu R, Pop LA, Burz C, Berindan Neagoe I. Human Chorionic Gonadotropin Improves the Proliferation and Regenerative Potential of Bone Marrow Adherent Stem Cells and the Immune Tolerance of Fetal Microchimeric Stem Cells In Vitro. Stem Cell Rev Rep. 2020 Jun;16(3):524 540. doi: 10.1007/s12015-020-09957-w. PMID: 32020407.
29. Cruceriu D, Baldasici O, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. The dual role of tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) in breast cancer: molecular insights and therapeutic approaches. Cell Oncol (Dordr). 2020 Feb;43(1):1-18. doi: 10.1007/s13402-019-00489-1. Epub 2020 Jan 3. PMID: 31900901.
30. Gavrilas LI , Cruceriu D , Ionescu C , Miere D , Balacescu O . Pro-apoptotic genes as new targets for single and combinatorial treatments with resveratrol and curcumin in colorectal cancer. Food Funct. 2019 Jun 19;10(6):3717-3726. doi: 10.1039/c9fo01014a. PMID: 31169275.
31. Seclaman E, Balacescu L, Balacescu O, Bejinar C, Udrescu M, Marian C, Sirbu IO, Anghel A. MicroRNAs mediate liver transcriptome changes upon soy diet intervention in mice. J Cell Mol Med. 2019 Mar;23(3):2263-2267. doi: 10.1111/jcmm.14140. Epub 2019 Jan 8. PMID: 30618122; PMCID: PMC6378209.
32. Cruceriu D, Balacescu O, Rakosy E. Calendula officinalis: Potential Roles in Cancer Treatment and Palliative Care. Integr Cancer Ther. 2018 Dec;17(4):1068-1078. doi: 10.1177/1534735418803766. Epub 2018 Oct 5. PMID: 30289008; PMCID: PMC6247547.
33. Balacescu O, Sur D, Cainap C, Visan S, Cruceriu D, Manzat-Saplacan R, Muresan MS, Balacescu L, Lisencu C, Irimie A. The Impact of miRNA in Colorectal Cancer Progression and Its Liver Metastases. Int J Mol Sci. 2018 Nov 22;19(12):3711. doi: 10.3390/ijms19123711. PMID: 30469518; PMCID: PMC6321452.
34. Wu X, Tudoran OM, Calin GA, Ivan M. The Many Faces of Long Noncoding RNAs in Cancer. Antioxid Redox Signal. 2018 Sep 20;29(9):922-935. doi: 10.1089/ars.2017.7293. Epub 2017 Oct 20. PMID: 28793797; PMCID: PMC6080117.
35. Balacescu O, Dumitrescu RG, Marian C. MicroRNAs Role in Prostate Cancer. Methods Mol Biol. 2018;1856:103-117. doi: 10.1007/978-1-4939-8751-1_6. PMID: 30178248.
36. Balacescu O, Petrut B, Tudoran O, Feflea D, Balacescu L, Anghel A, Sirbu IO, Seclaman E, Marian C. Urinary microRNAs for prostate cancer diagnosis, prognosis, and treatment response: are we there yet? Wiley Interdiscip Rev RNA. 2017 Nov;8(6). doi: 10.1002/wrna.1438. Epub 2017 Aug 16. PMID: 28815924.
37. Manzat Saplacan RM, Balacescu L, Gherman C, Chira RI, Craiu A, Mircea PA, Lisencu C, Balacescu O. The Role of PDGFs and PDGFRs in Colorectal Cancer. Mediators Inflamm. 2017;2017:4708076. doi: 10.1155/2017/4708076. Epub 2017 Jan 10. PMID: 28163397; PMCID: PMC5259650.
38. Miclaus M, Balacescu O, Has I, Balacescu L, Has V, Suteu D, Neuenschwander S, Keller I, Bruggmann R. Maize Cytolines Unmask Key Nuclear Genes That Are under the Control of Retrograde Signaling Pathways in Plants. Genome Biol Evol. 2016 Nov 17;8(11):3256-3270. doi: 10.1093/gbe/evw245. PMID: 27702813; PMCID: PMC5203784.
39. Belean B, Borda M, Ackermann J, Koch I, Balacescu O. Unsupervised image segmentation for microarray spots with irregular contours and inner holes. BMC Bioinformatics. 2015 Dec 23;16:412. doi: 10.1186/s12859-015-0842-3. PMID: 26698293; PMCID: PMC4690322.
40. Grozav A, Balacescu O, Balacescu L, Cheminel T, Berindan-Neagoe I, Therrien B. Synthesis, Anticancer Activity, and Genome Profiling of Thiazolo Arene Ruthenium Complexes. J Med Chem. 2015 Nov 12;58(21):8475-90. doi: 10.1021/acs.jmedchem.5b00855. Epub 2015 Oct 30. PMID: 26488797.
41. Tudoran O, Virtic O, Balacescu L, Lisencu C, Fetica B, Gherman C, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. Baseline blood immunological profiling differentiates between Her2-breast cancer molecular subtypes: implications for immunomediated mechanisms of treatment response. Onco Targets Ther. 2015 Nov 18;8:3415-23. doi: 10.2147/OTT.S91720. PMID: 26604799; PMCID: PMC4655955.
42. Tudoran O, Soritau O, Balacescu L, Visan S, Barbos O, Cojocneanu-Petric R, Balacescu O, Berindan Neagoe I. Regulation of stem cells-related signaling pathways in response to doxorubicin treatment in Hs578T triple-negative breast cancer cells. Mol Cell Biochem. 2015 Nov;409(1-2):163-76. doi: 10.1007/s11010-015-2522-z. Epub 2015 Jul 18. PMID: 26187676.
43. Manzat-Saplacan RM, Mircea PA, Balacescu L, Chira RI, Berindan-Neagoe I, Balacescu O. Can we change our microbiome to prevent colorectal cancer development? Acta Oncol. 2015;54(8):1085-95. doi: 10.3109/0284186X.2015.1054949. Epub 2015 Jun 15. PMID: 26073561.
44. Tudoran OM, Soritau O, Balacescu L, Pop L, Meurice G, Visan S, Lindberg S, Eniu A, Langel U, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. PDGF beta targeting in cervical cancer cells suggest a fine-tuning of compensatory signalling pathways to sustain tumourigenic stimulation. J Cell Mol Med. 2015 Feb;19(2):371-82. doi: 10.1111/jcmm.12449. Epub 2014 Oct 14. PMID: 25311137; PMCID: PMC4407607.
45. Tudoran O, Virtic O, Balacescu L, Pop L, Dragla F, Eniu A, Fetica B, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. Differential peripheral blood gene expression profile based on Her2 expression on primary tumors of breast cancer patients. PLoS One. 2014 Jul 28;9(7):e102764. doi: 10.1371/journal.pone.0102764. Erratum in: PLoS One. 2014;9(10):e110962. PMID: 25068292; PMCID: PMC4113305.
46. Balacescu O, Balacescu L, Tudoran O, Todor N, Rus M, Buiga R, Susman S, Fetica B, Pop L, Maja L, Visan S, Ordeanu C, Berindan-Neagoe I, Nagy V. Gene expression profiling reveals activation of the FA/BRCA pathway in advanced squamous cervical cancer with intrinsic resistance and therapy failure. BMC Cancer. 2014 Apr 8;14:246. doi: 10.1186/1471-2407-14-246. PMID: 24708616; PMCID: PMC4021393.
47. Virag P, Fischer-Fodor E, Perde-Schrepler M, Brie I, Tatomir C, Balacescu L, Berindan-Neagoe I, Victor B, Balacescu O. Oxaliplatin induces different cellular and molecular chemoresistance patterns in colorectal cancer cell lines of identical origins. BMC Genomics. 2013 Jul 16;14:480. doi: 10.1186/1471-2164-14-480. PMID: 23865481; PMCID: PMC3776436.
48. Winnepenninckx V, Lazar V, Michiels S, Dessen P, Stas M, Alonso SR, Avril MF, Ortiz Romero PL, Robert T, Balacescu O, Eggermont AM, Lenoir G, Sarasin A, Tursz T, van den Oord JJ, Spatz A; Melanoma Group of the European Organization for Research and Treatment of Cancer. Gene expression profiling of primary
49. cutaneous melanoma and clinical outcome. J Natl Cancer Inst. 2006 Apr 5;98(7):472-82. doi: 10.1093/jnci/djj103. PMID: 16595783.
50. Tudoran O, Soritau O, Balacescu O, Balacescu L, Braicu C, Rus M, Gherman C, Virag P, Irimie F, Berindan-Neagoe I. Early transcriptional pattern of angiogenesis induced by EGCG treatment in cervical tumour cells. J Cell Mol Med. 2012 Mar;16(3):520-30. doi: 10.1111/j.1582-4934.2011.01346.x. PMID: 21609393; PMCID: PMC3822928.
1. Brevet de inventie nr 128780/26.02.2016 cu titlul: Metoda de predictie a raspunsului la radio-chimioterapie in cancerul de col uterin prin studii de genomica functionala. Nr de inregistrare A/10036/2011. – Institutul Oncologic “Prof.Dr. I.Chiricuta” Cluj-Napoca (Reprezentanti: Balacescu Ovidiu Daniel si Balacescu Loredana); si Universitatea de Medicina si Farmacie “Iuliu Hatieganu” Cluj-Napoca Napoca (Reprezentanti: Irimie Alexandru, Berindan Neagoe Ioana).