Laboratorul de Genetică, Genomică şi Patologie Experimentală
Misiune:
Laboratorul de Genetică, Genomică și Patologie Experimentală (LGGPE) este parte a infrastructurii de cercetare a Institutului Oncologic „Prof. Dr. Ion Chiricuță” Cluj-Napoca, centru comprehensiv de cancer specializat în furnizarea de servicii medicale de prevenție, curative și paliative în domeniul oncologic și activitate de cercetare.
LGGPE, în colaborare cu departamentele clinice, este activ implicat în evaluarea caracteristicilor moleculare și celulare ale tumorilor maligne. LGGPE deține o platformă completă de genomică, microfluidică și facilități multiple de biologie moleculară, inclusiv facilități pentru studii in vitro și in vivo. Colaborările LGGPE sunt în domeniul cercetării fundamnatale și translaționale, având în prin plan abordări de genomică și microfluidică.
Strategia Departamentului
Strategia LGGPE se bazează în principal pe combinarea de cercetari fundamentale cu cele translaționale, cu scopul imbunătățirii diagnosticului precoce și al prognosticului pacientilor cu cancer. Studiile de cercetare fundamentala implica identificarea alterărilor moleculare transcriptomice implicate în dezvoltarea și evoluția tumorilor maligne, respectiv a răspunsului tumoral la variate tratamente cu compuși chimici și biochimici. Abordările translaționale implică integrarea datelor moleculare cu caracteristicile clinice ale pacienților pentru a identifica posibili biomarkeri care pot ajuta in predictionarea răspunsului la terapie în cancer. Strategii microfluidice de tip organ-on-a-chip sunt folosite pentru a explora interacțiunile celulare și moleculare complexe din micromediul tumoral care guvernează mișcarea celulelor tumorale și stromale în spații restrictionate mecanic 3D, tranziția epitelială la mezenchimală (EMT), potențialul stem-like tumorale și formarea sferoizilor. Domeniile noastre de interes includ cancerul de sân, de colon, ovarian, de col uterin, de prostată
Structura laborator
Tehnologiile state-of-the-art ale LGGP includ facilităţi de analiză la nivel genomic și genetic, analize de biologie moleculară, microfluidică respectiv facilități pentru studii in vitro și in vivo.
Activități de cercetare fundamentală și translațională:
1.Procesarea probelor biologice tumorale și normale (țesut, sânge, urina) în vederea izolarii de ADN, ARN, miARN, ser, plasmă, proteine;
2.Studii de evaluare a calității și cantității acizilor nucleici (ARN, miARN, ADN) prin analiza Lab-on-a chip (Bioanalyzor 2100), spectromtrie, (Nanodrop ND-1000) și fluorimetrie (Qubit 3.0).
3.Menținerea și întreținera liniilor celulare tumorale imortalizate.
4.Studii pe culturi celulare pentru evaluarea efectelor citotoxice și a mecanismelor moleculare modulate de diferiți compuși convenționali (medicamente citostatice și imunoterapice) și neconvenționali (compuși bioactivi).
5.Studii de apoptoza celulara prin citometrie in flux.
6.Design și fabricare de dispozitive de microfluidică specifice pentru caracterizarea fenotipului malign.
7.Studii de evaluare a capacității de migrare si invazie a liniilor celulare și a subpopulațiilor celulare izolate din probe biologice tumorale în dispozitive microfluidice
8.Identificarea alterarilor moleculare asociate fenotipului malign; studii de transcriptomică (tesut, sange integral) prin microarray (WHG) asupra speciilor de mARN, miARN, lncARN, circARN și analiza bioinformatică și biostatistică; validarea datelor obținute prin tehnologii complementare (PCR, qRT-PCR, IHC, Western Blot, ELISA) la nivel transcipțional și de traducere a informației genetice;
9.Teste de funcționalitate moleculară a datelor de microarray pe studii in vitro pe culturi celulare și model animal; Studii in silico (Ingenuity, Gene Spring, Cytoscope, KEGG, etc)
10.Utilizarea tehnologiilor de ARN interferență în vederea realizării controlului posttranscripțional al expresiei genelor;
11.Utilizarea de vectori plasmidici pentru supraexpimarea unor gene de interes în vederea identificării și validării rolului acestora în cancer precum și a mecanismelor de semnalizare implicate;
12.Evaluarea farmacogenomică a acţiunii medicamentelor citostatice (studii in vitro si in vivo); identificarea mecanismelor moleculare implicate in inducerea apoptozei si a rezistentei la terapie (culturi celulare, xenogrefe, tumori).
13.Studii de bioinformtică și biostatistică pentru analiza datelor de genomică din bazele de date de specialitate (TCGA, CCLE, etc);
14.Studii in silico pentru determinarea amorselor (primerilor) și a sondelor fluorescente (UPL) utilizate în analizele de expresie genică prin qRT-PCR;
Activități pentru suport clinic
Evaluarea infecțiilor nozocomiale. LGGPE are capacitate de testare rapida pe sistem performant de analiză IVD (Cepheid GeneXpert), prin PCR, pe probe biologice (spută, sânge), pentru:
•detecția C. difficile tcdB (gena toxinei B), cdt (gena toxinei binare) și deleția unei nucleotide la poziția 117 în gena tcdC (ribotipul tulpinii 027) a pacienților suspecți de infecția cu Clostridium difficile.
•detecția secvențelor genelor blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaOXA-48 și blaIMP-1 asociate cu Enterobacteriaceae, Pseudomonas aeruginosa și specii de Acinetobacter producătoare de carbapenemaze.
•detecția infecției cu Staphylococcus aureus (SA) și a genei mecA din stafilococii rezistenți la meticilină (MRSA).
•detecția genelor vanA/vanB din enterococii rezistenți la vancomicină (VRE).
•detecția diferitelor tipuri de bacterii rezistente precum: C difficile, metallo-β-lactamase (MBL)-cu patogeni gram-negativ” IMP, NDM și VIM, etc.
Detecția infecției cu SARS-Cov2 prin metoda RT-qPCR pe sistem PCR deschis și pe sistem PCR inchis (cartus-Xpert SARS-CoV-2)
1. Facilități complete pentru procesarea probelor biologice (țesut, sînge, urina): hote în flux laminar, set de centrifugi cu ăi fără răcire; politron pentru mărunțirea probelor tisulare; termoblocuri, băi de apa cu agitare termo-reglabile, vortexuri, centrifugi minispin, concentrator de acizi nucleici, frigidere, minicongelatoare, pipete; (achiziție aparatură 2007-2012)
2. Tancuri (stocatoare) de azot lichid (-1960C), ultracongelatoare (-800C), si congelatoare (-200C); (achiziție aparatura 2007-2010)
3. Platforma genetica si genomica Illumina: NGS NextSeq 550Dx si scanner iScan; (achizitie 2022).
4. Platforma microarray Agilent pentru: analize genomice transcripționale (mRNA, miRNA, lncRNA), hibridare genomică comparativă (CGH), analiza a cromatinei (ChIP-on chip) si metilare. (achiziție 2007)
5. Facilități bioinformatice pentru analize de genomică și funcționalitate moleculară: Bioconductor R, Feature Extraction, Gene Spring și Ingenuity; (licențe 2009 -prezent)
6. Aparat PCR (MiniAmp Thermal Cycler, Thermo) pentru amplificarea materialului genetic (ADN); (achiziție 2019)
7. Aparate de qRT-PCR (Light Cycler 480, si Cobas Z480, Roche Tehchnologies) utilizate pentru analiza de expresie genica si genotipare; (achiziție 2007 și 2020)
8. Tehnologii Lab-on-a-chip (Bioanalyzer 2100) și Spectrofotometru NanoDrop ND-1000 si Qubit 3.0 utilizate în QC pentru acizi nucleici și proteine; (achiziție 2002 UMF, parte din platforma de genomica comuna IOCN-UMF).
9. Facilități pentru evaluare de proteine: Mini-PROTEAN 3 unități pentru electroforeza și Western blot, cititor de placi pentru ELISA – UV-VIS, fluorescenta; (achizitie 2010-2017)
10. Facilități complete pentru culturi celulare: hota in flux laminar complet utilata, incubatoare cu CO2 termoreglabil (posibilitate de inducere hipoxie), microscop optic si in fluorescenta, Agitator de placi cu controlul temperaturii, Numarator automat de celule Sistem de evaluare a celulelor in timp real prin Time-Lapse imaging (Mini-incubator cu microscop: Biostation IMq) (achizitie 2009-2017).
11. Sisteme pentru izolarea și caracterizarea nanoparticulelor și a veziculelor extracelulare (exosomi): IZON Automatic Fraction Collector; IZON Exoid (Achizitie 2023)
12. Platforma pentru microfabricatie dispozitive microfluidice: Aparat oxigen plasma, Cuptor, centrifuga (Laurell), Aparat de litografiat (UV-KUB3) (achizitie 2017),
13. Sistem de evaluare si sortare a celulelor (S3 sorter Bio-Rad) (achizitie 2017)
14. Sistem IVC pentru cresterea in conditii SPF a animalelor de laborator mici (achizitie 2017)
Infrastructura programata a fi achizitionata in 2025: (Finantare prin proiect ROGEN- Dezvoltarea Cercetarii Genomice in Romania)
1. Instrument de partitionare la nivel unicelular a suspensiilor celulare, suport pentru analiza de single-cell sequencing (ADN, ARN si profil imun).
2. Sistem complet de analiza Westen-Blot cu cititor de geluri in fluorescenta si chemo-luminiscenta (iBright FL1500 Imaging System)
3. Statie de pipetare automata pregatire librarii NGS, compatibila cu o gama larga de kituri de analiza NGS, destinate pentru paltformele de secventiere Illumina
4. Dezagregator tisular, cu controlul crio-conservarii probelor, ca suport pentru analizele de secventiere unicelulara (single-cell).
5. Sistem automatizat, de evaluare microscopica motorizata a culturilor celulare 2D-3D cu unitate de injectie reactivi.
Europene, parteneriate:
1. HORIZON 2020 – ERANET-PERMED: Modele epigenomice și de învățare automată pentru predictia cancerului pancreatic: dezvoltarea unui nou algoritm ce integreaza biomarkeri clinici, omici, de metilare a ADN-ului și factori de mediu pentru detectarea precoce a cancerului pancreatic. Acronim: IMAGENE (990.000 Lei) (274/2022) (2022-12024).
2. HORIZON 2020- ERANET-TRANSCAN-3- Predicția răspunsului la imunoterapie bazată de inteligența artificială – TANGERINE – 319 ⁄ 2022- 2024 (990.000 lei) (2022-2024). (2022-2024).
Naționale, coordonare:
1. PED – (PN-IV-P7-7.1-PED-2024-2349) Dezvoltarea unei platforme integrate pentru evaluarea fenotipului migrator al celulelor tumorale bazată pe dispozitivie microfluidice și algoritmi de învățare automată – MCELLML, (723 8680 lei).
2. TE – (PN-III-P1-1.1-TE-2021)- Abordari microfluidice pentru reconstructia nisei metastatice in cancerul de san – MIOCRONICHE – TE52/2022 (450.000 lei)
3. PED – (PN-III-P2-2_1-PED) -Explorarea mecanismelor moleculare mediate de exozomii plasmatici responsabili de fenotipul migrator al celulelor primare de cancer mamar folosind abordări microfluidice și genomice- EXOMICROVEL – PED556/2020 (600.000 lei).
4. PN-III-P1-1.1-PD-2019-0846-Studii in vitro privind proprietățile antitumorale și chemopreventive ale β-criptoxantinei, zeaxantinei și a extractului lipofil de cătină (Hippophae rhamnoides L.) în cancerul de sân. BREASTMICROGENIMICS, 236 150 lei, (2020-2022)
5. PNIII (UEFISCDI) The role of miRNAs in the regulation of FA/BRCA pathway with implications in baseline resistance of cervical cancer – Rez-miR-Cervix – 247PED/2017 (475.000 lei).
6. PNII (UEFISCDI) – Analiza miARN ca posibili biomarkeri cu valoare de predictie pentru tratamentul cancerului de col uterin, în relaţie cu expunerea la factorii de mediu, arsen, ftalaţi şi cotinina. (Cervicall-arsen-array) 3.000.000 RON (96/2012)
7. POC- p37-783- Abordari genomice si microfluidice in blocarea invaziei si a metastazarii cancerului de san BREASTMICROGENOMICS (8.617.500 RON) (2016-2020)
8. TE – (PN-II-RU-TE-2014) – Rolul ARN-urilor non-codante lungi in rezistenta celulelor stem-like tumorale la terapie in cancerul de san – BREAST-STEM-RES – TE76/2015 (550.000 lei)
9. PNII (UEFISCDI) – Analiza miARN ca posibili biomarkeri cu valoare de predictie pentru tratamentul cancerului de col uterin, în relaţie cu expunerea la factorii de mediu, arsen, ftalaţi şi cotinina. (Cervicall-arsen-array) 3.000.000 RON (96/2012).
10. PD (PN-II-RU-PD-2011) – Dubla tintire a VEGFA si PDGFb in cancerul cervical: posibilitate terapeutica antiangiogenica utilizand CPPs receptor specifice – PD102/2012 (300.000 lei)
11. CNMP (PNCDI II) – Identificarea profilelor moleculare transcriptomice in cancerul de col uterin avansat prin studii de genomica functionala. CERVIX-array. 1.200.000 RON (IOCN) (2008-2011). (42-160/2008).
12. CNCSIS- IDEI – Identificarea prin reactia microarray a unor biomarkeri tumorali cu valoare de predictie noninvaziva in cancerul de prostata. 1.000.000 RON (IOCN) (ID_314/2007)
13. CNMP (PNCDI II) Modulation of pro/anticarcinogenic effect of toxic chemical agents in breast cancer multitargeted therapy (CANCERTER-p53) (PN-II-PT-PCCA-2013-4-0030), (196/2014), 690.700 RON (IOCN) (2013-2017).
14. PNII (UEFISCDI) – Evaluarea diversităţii genetice existente la nivelul cultivarelor românesti, în vederea obţinerii de hibrizi noi, cu trăsături superioare şi productivitate (ZEAHYBR/2012) (UEFISCDI, PN-II-PT-PCCA) 500.000 RON (2012-2015)
15. CNMP (PNCDI II) – Definirea profilului molecular transcriptomic in predictia statusului clinic in cancerele mamare rezistente la antracicline. Definirea bolii metastatice in raport cu tumora primara. BREAST-OMICS. 800.000 RON partener IOCN (41-029/2007)
16. POSDRU-TDM – Sistem de formare profesională a personalului medical în domeniul noilor tehnologii din sistemul de sănătate (diagnostic molecular) POSDRU/81/3.2/S/58819
Naționale, colaborare:
1. PS/272/PS_P5/OP1/ROS1.1/PS_P5_RSO1.1_A9/- Dezvoltarea Retelei de Genomica in Romania (ROGEN) 2025-2030 (1.899.555 Euro, IOCN).
2. PD – (PN-III-P1-1.1-PD) – Investigarea rolului factorului de transcriere ELK3 în migrarea celulelor de cancer de sân triplu negativ, într-o abordare genomică și microfluidică – MICROGENOELK – PD0525/2021 (250.000 lei). Colaborare cu Universitatea „Babeș-Bolyai”
3. PD – (PN-III-P1-1.1-PD) – Investigarea rolului factorului de transcriere ELK3 în migrarea celulelor de cancer de sân triplu negativ, într-o abordare genomică și microfluidică – MICROGENOELK – PD0525/2021 (250.000 lei). Colaborare cu Universitatea „Babeș-Bolyai”.
4. PN-III-P1-1.1-TE-2021-1512 – „Functional immune profiling in peripheral mononuclear cells to inform personalized approaches in patients with systemic lupus erythematosus” – FiLup (450.000,00 lei) (2022-2024)
5. PD – (PN-III-P1-1.1-PD) – Explorarea potențialului terapeutic al curcuminei pe linii celulare de cancer colorectal rezistente la irinotecan PD0469/2019 (250.000 lei). Colaborare cu Universitatea de Medicină și Farmacie „Iuliu Hațieganu”
6. PN-III-P1-1.1-TE-2019 -1603- “Next generation sequencing – a valuable tool for assessing the impact of additional somatic mutations in young patients with non-BCR-ABL myeloproliferative neoplasms” (2020-2022).
7. CDI, ID P_40_318, Cercetare, dezvoltare tehnologică și inovare (CDI) în sprijinul competitivității economice și dezvoltării afacerilor” Transfer de cunoștințe în aplicații clinice ale biogenomicii în oncologie și domenii conexe- BIOGENONCO, Colaborare cu Universitatea de Medicină și Farmacie „Iuliu Hațieganu” (2018-2022).
8. CDI, ID P_37_762 Cod MySMIS: 103587- HINT „Hiperuricemia induce INflamaţie: Ţintirea rolului central al acidului uric în bolile reumatologice şi cardiovasculare”, Acțiunea 1.1.4 Atragerea de personal cu competențe avansate din străinătate pentru consolidarea capacității de CD. (9.352.330 lei din care asistenţa financiară nerambursabilă 8.617.499,04 lei) (2016-2020).

Specializare: Biotehnologii moleculare, Genomică funcțională
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Specializare: Biologie moleculară, Genomică funcțională
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Specializare: Biologie moleculară, Genomică funcțională
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Specializare: Biotehnologii moleculare
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Specializare: Biochimie, Biologie moleculară și celulară, Genomică funcțională, Inginerie biochimică
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Specializare: Genomică funcțională
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Specializare: Biochimie, Biologie moleculară, Farmacogenomică, Genomică funcțională
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală

Specializare: Biologie
Departamente cercetare: Genomică Funcţională, Proteomică şi Patologie Experimentală
1. Achimas-Cadariu P, Kubelac PM, Pasca A, Gata VA, Fetica B, Balacescu O, Fischer-Fodor E, Focsan M, Astilean S, Vlad CI. Intraoperative imaging of residual ovarian cancer after neoadjuvant chemotherapy using indocyanine green. Int J Gynecol Cancer. 2024 Nov 4:ijgc-2024-005568. doi:10.1136/ijgc-2024-005568. Epub ahead of print. PMID: 39496391.
2. Major TJ, Takei R, Matsuo H, Leask MP, Sumpter NA, Topless RK, Shirai Y, Wang W, Cadzow MJ, Phipps-Green AJ, Li Z, Ji A, Merriman ME, Morice E, Kelley EE, Wei WH, McCormick SPA, Bixley MJ, Reynolds RJ, Saag KG, Fadason T, Golovina E, O’Sullivan JM, Stamp LK, Dalbeth N, Abhishek A, Doherty M, Roddy E, Jacobsson LTH, Kapetanovic MC, Melander O, Andrés M, Pérez-Ruiz F, Torres RJ, Radstake T, Jansen TL, Janssen M, Joosten LAB, Liu R, Gaal OI, Crişan TO, Rednic S, Kurreeman F, Huizinga TWJ, Toes R, Lioté F, Richette P, Bardin T, Ea HK, Pascart T, McCarthy GM, Helbert L, Stibůrková B, Tausche AK, Uhlig T, Vitart V, Boutin TS, Hayward C, Riches PL, Ralston SH, Campbell A, MacDonald TM; FAST Study Group; Nakayama A, Takada T, Nakatochi M, Shimizu S, Kawamura Y, Toyoda Y, Nakaoka H, Yamamoto K, Matsuo K, Shinomiya N, Ichida K; Japan Gout Genomics Consortium; Lee C; Asia Pacific Gout Consortium; Bradbury LA, Brown MA, Robinson PC, Buchanan RRC, Hill CL, Lester S, Smith MD, Rischmueller M, Choi HK, Stahl EA, Miner JN, Solomon DH, Cui J, Giacomini KM, Brackman DJ, Jorgenson EM; GlobalGout Genetics Consortium; Liu H, Susztak K; 23andMe Research Team; Shringarpure S, So A, Okada Y, Li C, Shi Y, Merriman TR. A genome-wide association analysis reveals new pathogenic pathways in gout. Nat Genet. 2024 Nov;56(11):2392-2406. doi: 10.1038/s41588-024-01921-5. Epub 2024 Oct 15. Erratum in: Nat Genet. 2024 Nov;56(11):2577. doi: 10.1038/s41588-024-02017-w. PMID: 39406924.
3. Cruceriu D, Balacescu L, Baldasici O, Gaal OI, Balacescu O, Russom A, Irimia D, Tudoran O. Gene expression-phenotype association study reveals the dual role of TNF-α/TNFR1 signaling axis in confined breast cancer cell migration. Life Sci. 2024 Oct 1;354:122982. doi: 10.1016/j.lfs.2024.122982. Epub 2024 Aug 14. PMID: 39151886.
4. Badii M, Nica V, Straton AR, Kischkel B, Gaal O, Cabău G, Klück V, Hotea I; HINT Consortium; Novakovic B, Pamfil C, Rednic S, Netea MG, Popp RA, Joosten LAB, Crișan TO. Downregulation of type I interferon signalling pathway by urate in primary human PBMCs. Immunology. 2024 Oct 1. doi: 10.1111/imm.13858. Epub ahead of print. PMID: 39354748.
5. Baldasici O, Soritau O, Roman A, Lisencu C, Visan S, Maja L, Pop B, Fetica B, Cismaru A, Vlase L, Balacescu L, Balacescu O, Russom A, Tudoran O. The transcriptional landscape of cancer stem-like cell functionality in breast cancer. J Transl Med. 2024 Jun 3;22(1):530. doi: 10.1186/s12967-024-05281-w. PMID: 38831317; PMCID: PMC11149333.
6. Gaal OI, Liu R, Marginean D, Badii M, Cabău G, Hotea I, Nica V, Colcear D; HINT Consortium; Pamfil C, Merriman TR, Rednic S, Popp RA, Crișan TO, Joosten LAB. GWAS-identified hyperuricemia-associated IGF1R variant rs6598541 has a limited role in urate mediated inflammation in human mononuclear cells. Sci Rep. 2024 Feb 12;14(1):3565. doi: 10.1038/s41598-024-53209-7. PMID: 38347000; PMCID: PMC10861580.
7. Lisencu LA, Roman A, Paşca A, Irimie A, Lisencu C, Negrutiu M, Fetica B, Cismaru A, Balacescu O, Tudoran O, Lisencu C. Mammographic assessment of breast density as a tool for predicting the response to neoadjuvant therapy in breast cancer patients. Med Pharm Rep. 2024 Jan;97(1):43-55. doi: 10.15386/mpr-2554. Epub 2024 Jan 29. PMID: 38344331; PMCID: PMC10852117.
8. Abbasi Aval N, Lahchaichi E, Tudoran O, Fayazbakhsh F, Heuchel R, Löhr M, Pettersson T, Russom A. Assessing the Layer-by-Layer Assembly of Cellulose Nanofibrils and Polyelectrolytes in Pancreatic Tumor Spheroid Formation. Biomedicines. 2023 Nov 15;11(11):3061. doi: 10.3390/biomedicines11113061. PMID: 38002061; PMCID: PMC10669291.
9. Cabău G, Gaal O, Badii M, Nica V, Mirea AM, Hotea I; HINT-consortium; Pamfil C, Popp RA, Netea MG, Rednic S, Crișan TO, Joosten LAB. Hyperuricemia remodels the serum proteome toward a higher inflammatory state. iScience. 2023 Sep 14;26(10):107909. doi: 10.1016/j.isci.2023.107909. PMID: 37810213; PMCID: PMC10550725.
10. Visan S, Soritau O, Tatomir C, Baldasici O, Balacescu L, Balacescu O, Muntean P, Gherasim C, Pintea A. The Bioactive Properties of Carotenoids from Lipophilic Sea buckthorn Extract (Hippophae rhamnoides L.) in Breast Cancer Cell Lines. Molecules. 2023 Jun 1;28(11):4486. doi: 10.3390/molecules28114486. PMID: 37298962; PMCID: PMC10254770.
11. Oravetz K, Todea AV, Balacescu O, Cruceriu D, Rakosy-Tican E. Potential antitumor activity of garlic against colorectal cancer: focus on the molecular mechanisms of action. Eur J Nutr. 2023 Sep;62(6):2347-2363. doi: 10.1007/s00394-023-03166-0. Epub 2023 May 4. PMID: 37140645.
12. Baloi A, Costea C, Gutt R, Balacescu O, Turcu F, Belean B. Hexagonal-Grid-Layout Image Segmentation Using Shock Filters: Computational Complexity Case Study for Microarray Image Analysis Related to Machine Learning Approaches. Sensors (Basel). 2023 Feb 26;23(5):2582. doi: 10.3390/s23052582. PMID: 36904788; PMCID: PMC10007319.
13. Ardelean IV, Bălăcescu L, Sicora O, Bălăcescu O, Mladin L, Haș V, Miclăuș M. Maize cytolines as models to study the impact of different cytoplasms on gene expression under heat stress conditions. BMC Plant Biol. 2023 Jan 2;23(1):4. doi: 10.1186/s12870-022-04023-8. PMID: 36588161; PMCID: PMC9806912.
14. Paraschiv M, Csiki M, Diaconeasa Z, Socaci S, Balacescu O, Rakosy-Tican E, Cruceriu D. Phytochemical Profile and Selective Cytotoxic Activity of a Solanum bulbocastanum Dun. Methanolic Extract on Breast Cancer Cells. Plants (Basel). 2022 Nov 27;11(23):3262. doi: 10.3390/plants11233262. PMID: 36501302; PMCID: PMC9740103.
15. Baldasici O, Balacescu L, Cruceriu D, Roman A, Lisencu C, Fetica B, Visan S, Cismaru A, Jurj A, Barbu Tudoran L, Pileczki V, Vlase L, Tudoran O, Balacescu O. Circulating Small EVs miRNAs as Predictors of Pathological Response to Neo-Adjuvant Therapy in Breast Cancer Patients. Int J Mol Sci. 2022 Oct 20;23(20):12625. doi: 10.3390/ijms232012625. PMID: 36293478; PMCID: PMC9604084.
16. Ivan M, Fishel ML, Tudoran OM, Pollok KE, Wu X, Smith PJ. Hypoxia signaling: Challenges and opportunities for cancer therapy. Semin Cancer Biol. 2022 Oct;85:185-195. doi: 10.1016/j.semcancer.2021.10.002. Epub 2021 Oct 7. PMID: 34628029; PMCID: PMC8986888.
17. Lisencu LA, Roman A, Visan S, Bonci EA, Pașca A, Grigorescu E, Mustea E, Cismaru A, Irimie A, Lisencu C, Balacescu L, Balacescu O, Tudoran O. The Role of miR-375-3p, miR-210-3p and Let-7e-5p in the Pathological Response of Breast Cancer Patients to Neoadjuvant Therapy. Medicina (Kaunas). 2022 Oct 20;58(10):1494. doi: 10.3390/medicina58101494. PMID: 36295655; PMCID:PMC9608077.
18. Baldasici O, Pileczki V, Cruceriu D, Gavrilas LI, Tudoran O, Balacescu L, Vlase L, Balacescu O. Breast Cancer-Delivered Exosomal miRNA as Liquid Biopsy Biomarkers for Metastasis Prediction: A Focus on Translational Research with Clinical Applicability. Int J Mol Sci. 2022 Aug 19;23(16):9371. doi: 10.3390/ijms23169371. PMID: 36012638; PMCID: PMC9408950.
19. Gavrilas LI, Cruceriu D, Mocan A, Loghin F, Miere D, Balacescu O. Plant- Derived Bioactive Compounds in Colorectal Cancer: Insights from Combined Regimens with Conventional Chemotherapy to Overcome Drug-Resistance. Biomedicines. 2022 Aug 11;10(8):1948. doi: 10.3390/biomedicines10081948. PMID: 36009495; PMCID: PMC9406120.
20. Gabora K, Bălăcescu O, Trifa A, Morariu AM, Pop B, Vişan S, Fetica B, Piciu A, Piciu D. Thyroid carcinoma associated with other primary neoplasms, a single center study. Med Pharm Rep. 2022 Jul;95(3):275-281. doi: 10.15386/mpr-2346. Epub 2022 Jul 26. PMID: 36060512; PMCID: PMC9387584.
21. Borlan R, Focsan M, Perde-Schrepler M, Soritau O, Campu A, Gaina L, Pall E, Pop B, Baldasici O, Gherman C, Stoia D, Maniu D, Astilean S. Antibody- functionalized theranostic protein nanoparticles for the synergistic deep red fluorescence imaging and multimodal therapy of ovarian cancer. Biomater Sci. 2021 Sep 14;9(18):6183-6202. doi: 10.1039/d1bm01002f. PMID: 34346411.
22. Cruceriu D, Diaconeasa Z, Socaci S, Socaciu C, Balacescu O, Rakosy-Tican E. Extracts of the Wild Potato Species Solanum chacoense on Breast Cancer Cells: Biochemical Characterization, In Vitro Selective Cytotoxicity and Molecular Effects. Nutr Cancer. 2021;73(4):630-641. doi: 10.1080/01635581.2020.1761407. Epub 2020 May 6. PMID: 32372670.
23. Sur D, Balacescu L, Cainap SS, Visan S, Pop L, Burz C, Havasi A, Buiga R, Cainap C, Irimie A, Balacescu O. Predictive Efficacy of MiR-125b-5p, MiR-17-5p, and MiR-185-5p in Liver Metastasis and Chemotherapy Response Among Advanced Stage Colorectal Cancer Patients. Front Oncol. 2021 May 18;11:651380. doi: 10.3389/fonc.2021.651380. PMID: 34084747; PMCID: PMC8167052.
24. Cruceriu D, Baldasici O, Balacescu L, Gligor-Popa S, Flonta M, Man MA, Visan S, Vlad C, Trifa AP, Balacescu O, Achimas-Cadariu P. Critical Aspects Concerning the Development of a Pooling Approach for SARS-CoV-2 Diagnosis Using Large-Scale PCR Testing. Viruses. 2021 May 13;13(5):902. doi: 10.3390/v13050902. PMID: 34067983; PMCID: PMC8152296.
25. Cainap C, Ungur RA, Bochis OV, Achimas P, Vlad C, Havasi A, Vidrean A, Farcas A, Tat T, Gherman A, Piciu A, Bota M, Constantin AM, Pop LA, Maniu D, Crisan O, Cioban CV, Balacescu O, Coza O, Balacescu L, Marta MM, Dronca E, Cainap S. Partnering bevacizumab with irinotecan as first line-therapy of metastatic colorectal cancer improves progression free survival-A retrospective analysis. PLoS One. 2021 Apr 28;16(4):e0248922. doi: 10.1371/journal.pone.0248922. PMID: 33909622; PMCID: PMC8081186.
26. Wu X, Niculite CM, Preda MB, Rossi A, Tebaldi T, Butoi E, White MK, Tudoran OM, Petrusca DN, Jannasch AS, Bone WP, Zong X, Fang F, Burlacu A, Paulsen MT, Hancock BA, Sandusky GE, Mitra S, Fishel ML, Buechlein A, Ivan C, Oikonomopoulos S, Gorospe M, Mosley A, Radovich M, Davé UP, Ragoussis J, Nephew KP, Mari B, McIntyre A, Konig H, Ljungman M, Cousminer DL, Macchi P, Ivan M. Regulation of cellular sterol homeostasis by the oxygen responsive noncoding RNA lincNORS. Nat Commun. 2020 Sep 21;11(1):4755. doi: 10.1038/s41467-020-18411-x. Erratum in: Nat Commun. 2020 Nov 6;11(1):5737. doi: 10.1038/s41467-020-19708-7. PMID: 32958772; PMCID: PMC7505984.
27. Cainap C, Pop LA, Balacescu O, Cainap SS. Early diagnosis and screening in lung cancer. Am J Cancer Res. 2020 Jul 1;10(7):1993-2009. PMID: 32774997; PMCID: PMC7407360.
28. Cismaru AC, Soritau O, Jurj AM, Raduly LZ, Pop B, Bocean C, Miclea D, Baldasici O, Moldovan C, Urian L, Braicu C, Chira S, Cojocneanu R, Pop LA, Burz C, Berindan Neagoe I. Human Chorionic Gonadotropin Improves the Proliferation and Regenerative Potential of Bone Marrow Adherent Stem Cells and the Immune Tolerance of Fetal Microchimeric Stem Cells In Vitro. Stem Cell Rev Rep. 2020 Jun;16(3):524 540. doi: 10.1007/s12015-020-09957-w. PMID: 32020407.
29. Cruceriu D, Baldasici O, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. The dual role of tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) in breast cancer: molecular insights and therapeutic approaches. Cell Oncol (Dordr). 2020 Feb;43(1):1-18. doi: 10.1007/s13402-019-00489-1. Epub 2020 Jan 3. PMID: 31900901.
30. Gavrilas LI , Cruceriu D , Ionescu C , Miere D , Balacescu O . Pro-apoptotic genes as new targets for single and combinatorial treatments with resveratrol and curcumin in colorectal cancer. Food Funct. 2019 Jun 19;10(6):3717-3726. doi: 10.1039/c9fo01014a. PMID: 31169275.
31. Seclaman E, Balacescu L, Balacescu O, Bejinar C, Udrescu M, Marian C, Sirbu IO, Anghel A. MicroRNAs mediate liver transcriptome changes upon soy diet intervention in mice. J Cell Mol Med. 2019 Mar;23(3):2263-2267. doi: 10.1111/jcmm.14140. Epub 2019 Jan 8. PMID: 30618122; PMCID: PMC6378209.
32. Cruceriu D, Balacescu O, Rakosy E. Calendula officinalis: Potential Roles in Cancer Treatment and Palliative Care. Integr Cancer Ther. 2018 Dec;17(4):1068-1078. doi: 10.1177/1534735418803766. Epub 2018 Oct 5. PMID: 30289008; PMCID: PMC6247547.
33. Balacescu O, Sur D, Cainap C, Visan S, Cruceriu D, Manzat-Saplacan R, Muresan MS, Balacescu L, Lisencu C, Irimie A. The Impact of miRNA in Colorectal Cancer Progression and Its Liver Metastases. Int J Mol Sci. 2018 Nov 22;19(12):3711. doi: 10.3390/ijms19123711. PMID: 30469518; PMCID: PMC6321452.
34. Wu X, Tudoran OM, Calin GA, Ivan M. The Many Faces of Long Noncoding RNAs in Cancer. Antioxid Redox Signal. 2018 Sep 20;29(9):922-935. doi: 10.1089/ars.2017.7293. Epub 2017 Oct 20. PMID: 28793797; PMCID: PMC6080117.
35. Balacescu O, Dumitrescu RG, Marian C. MicroRNAs Role in Prostate Cancer. Methods Mol Biol. 2018;1856:103-117. doi: 10.1007/978-1-4939-8751-1_6. PMID: 30178248.
36. Balacescu O, Petrut B, Tudoran O, Feflea D, Balacescu L, Anghel A, Sirbu IO, Seclaman E, Marian C. Urinary microRNAs for prostate cancer diagnosis, prognosis, and treatment response: are we there yet? Wiley Interdiscip Rev RNA. 2017 Nov;8(6). doi: 10.1002/wrna.1438. Epub 2017 Aug 16. PMID: 28815924.
37. Manzat Saplacan RM, Balacescu L, Gherman C, Chira RI, Craiu A, Mircea PA, Lisencu C, Balacescu O. The Role of PDGFs and PDGFRs in Colorectal Cancer. Mediators Inflamm. 2017;2017:4708076. doi: 10.1155/2017/4708076. Epub 2017 Jan 10. PMID: 28163397; PMCID: PMC5259650.
38. Miclaus M, Balacescu O, Has I, Balacescu L, Has V, Suteu D, Neuenschwander S, Keller I, Bruggmann R. Maize Cytolines Unmask Key Nuclear Genes That Are under the Control of Retrograde Signaling Pathways in Plants. Genome Biol Evol. 2016 Nov 17;8(11):3256-3270. doi: 10.1093/gbe/evw245. PMID: 27702813; PMCID: PMC5203784.
39. Belean B, Borda M, Ackermann J, Koch I, Balacescu O. Unsupervised image segmentation for microarray spots with irregular contours and inner holes. BMC Bioinformatics. 2015 Dec 23;16:412. doi: 10.1186/s12859-015-0842-3. PMID: 26698293; PMCID: PMC4690322.
40. Grozav A, Balacescu O, Balacescu L, Cheminel T, Berindan-Neagoe I, Therrien B. Synthesis, Anticancer Activity, and Genome Profiling of Thiazolo Arene Ruthenium Complexes. J Med Chem. 2015 Nov 12;58(21):8475-90. doi: 10.1021/acs.jmedchem.5b00855. Epub 2015 Oct 30. PMID: 26488797.
41. Tudoran O, Virtic O, Balacescu L, Lisencu C, Fetica B, Gherman C, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. Baseline blood immunological profiling differentiates between Her2-breast cancer molecular subtypes: implications for immunomediated mechanisms of treatment response. Onco Targets Ther. 2015 Nov 18;8:3415-23. doi: 10.2147/OTT.S91720. PMID: 26604799; PMCID: PMC4655955.
42. Tudoran O, Soritau O, Balacescu L, Visan S, Barbos O, Cojocneanu-Petric R, Balacescu O, Berindan Neagoe I. Regulation of stem cells-related signaling pathways in response to doxorubicin treatment in Hs578T triple-negative breast cancer cells. Mol Cell Biochem. 2015 Nov;409(1-2):163-76. doi: 10.1007/s11010-015-2522-z. Epub 2015 Jul 18. PMID: 26187676.
43. Manzat-Saplacan RM, Mircea PA, Balacescu L, Chira RI, Berindan-Neagoe I, Balacescu O. Can we change our microbiome to prevent colorectal cancer development? Acta Oncol. 2015;54(8):1085-95. doi: 10.3109/0284186X.2015.1054949. Epub 2015 Jun 15. PMID: 26073561.
44. Tudoran OM, Soritau O, Balacescu L, Pop L, Meurice G, Visan S, Lindberg S, Eniu A, Langel U, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. PDGF beta targeting in cervical cancer cells suggest a fine-tuning of compensatory signalling pathways to sustain tumourigenic stimulation. J Cell Mol Med. 2015 Feb;19(2):371-82. doi: 10.1111/jcmm.12449. Epub 2014 Oct 14. PMID: 25311137; PMCID: PMC4407607.
45. Tudoran O, Virtic O, Balacescu L, Pop L, Dragla F, Eniu A, Fetica B, Balacescu O, Berindan-Neagoe I. Differential peripheral blood gene expression profile based on Her2 expression on primary tumors of breast cancer patients. PLoS One. 2014 Jul 28;9(7):e102764. doi: 10.1371/journal.pone.0102764. Erratum in: PLoS One. 2014;9(10):e110962. PMID: 25068292; PMCID: PMC4113305.
46. Balacescu O, Balacescu L, Tudoran O, Todor N, Rus M, Buiga R, Susman S, Fetica B, Pop L, Maja L, Visan S, Ordeanu C, Berindan-Neagoe I, Nagy V. Gene expression profiling reveals activation of the FA/BRCA pathway in advanced squamous cervical cancer with intrinsic resistance and therapy failure. BMC Cancer. 2014 Apr 8;14:246. doi: 10.1186/1471-2407-14-246. PMID: 24708616; PMCID: PMC4021393.
47. Virag P, Fischer-Fodor E, Perde-Schrepler M, Brie I, Tatomir C, Balacescu L, Berindan-Neagoe I, Victor B, Balacescu O. Oxaliplatin induces different cellular and molecular chemoresistance patterns in colorectal cancer cell lines of identical origins. BMC Genomics. 2013 Jul 16;14:480. doi: 10.1186/1471-2164-14-480. PMID: 23865481; PMCID: PMC3776436.
48. Winnepenninckx V, Lazar V, Michiels S, Dessen P, Stas M, Alonso SR, Avril MF, Ortiz Romero PL, Robert T, Balacescu O, Eggermont AM, Lenoir G, Sarasin A, Tursz T, van den Oord JJ, Spatz A; Melanoma Group of the European Organization for Research and Treatment of Cancer. Gene expression profiling of primary
49. cutaneous melanoma and clinical outcome. J Natl Cancer Inst. 2006 Apr 5;98(7):472-82. doi: 10.1093/jnci/djj103. PMID: 16595783.
50. Tudoran O, Soritau O, Balacescu O, Balacescu L, Braicu C, Rus M, Gherman C, Virag P, Irimie F, Berindan-Neagoe I. Early transcriptional pattern of angiogenesis induced by EGCG treatment in cervical tumour cells. J Cell Mol Med. 2012 Mar;16(3):520-30. doi: 10.1111/j.1582-4934.2011.01346.x. PMID: 21609393; PMCID: PMC3822928.
1. Brevet de inventie nr 128780/26.02.2016 cu titlul: Metoda de predictie a raspunsului la radio-chimioterapie in cancerul de col uterin prin studii de genomica functionala. Nr de inregistrare A/10036/2011. – Institutul Oncologic “Prof.Dr. I.Chiricuta” Cluj-Napoca (Reprezentanti: Balacescu Ovidiu Daniel si Balacescu Loredana); si Universitatea de Medicina si Farmacie “Iuliu Hatieganu” Cluj-Napoca Napoca (Reprezentanti: Irimie Alexandru, Berindan Neagoe Ioana).